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分子生物學樣本采樣要求
發(fā)布時間:2024-03-07
作者:里來醫(yī)學

 

注:以下所有樣本盡量新鮮!

1、動物組織采集樣本量盡量保證在綠豆大小,約200mg以上

 取材應在冰上進行,取材后組織用生理鹽水沖洗干凈,去除血漬和污物,并剔除非研究所需的組織;

② 吸干水漬并切小塊,放入已標記的凍存管中,液氮速凍后,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

2、貼壁細胞RNA采集樣本樣本量1*10^8以上

RNA試劑盒法:

① 用微量移液器將細胞培養(yǎng)液吸除干凈,加入1ml 4℃預冷PBS溶液,輕搖洗滌;

② 將PBS吸除干凈后,再加入1ml PBS,用細胞刮收集細胞,3000rpm離心10min,棄去上清液,收集細胞沉淀,液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存;

③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說明書為準。提取樣本經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

Trizol法:

① 貼壁細胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,去除培養(yǎng)液;

② 每10c㎡培養(yǎng)面積加入1ml Trizol試劑;

③ 用1ml槍頭反復吹打,使Trizol與細胞充分接觸并消化;

④ 將上述溶液轉(zhuǎn)移到試管中,用一次性注射器(或者槍頭)反復吹打細胞,直至看不見成團的細胞塊,使溶液呈現(xiàn)清亮且不粘稠的狀態(tài);

⑤ 經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

3、懸浮細胞RNA采集樣本量1*10^8以上

RNA試劑盒法:

① 懸浮細胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,3000rpm,離心10min,去除培養(yǎng)液;

② 收集細胞后,加入1ml 4℃預冷PBS溶液,輕搖洗滌,3000rpm,離心10min,棄去上清液,收集細胞沉淀,液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存;

③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說明書為準。提取樣本經(jīng)氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱。

Trizol法:

① 懸浮細胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,離心收集細胞,去除培養(yǎng)液

② 保留的細胞用PBS快速洗一次,離心除去PBS;

③ 每1×10^6個細胞加1ml Trizol試劑,用一次性注射器進行反復吹打直至看不見成團的細胞塊,整個溶液呈清亮且不粘稠的狀態(tài);

④ 經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

4、血液樣本采集

全血樣本(以下方法步驟僅供參考)

哺乳動物需要采集白細胞進行后續(xù)實驗,(具體方法需參考各種分離液試劑說明書)

① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使血液與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立放置;

② 每1ml新鮮抗凝血中加入10ml紅細胞裂解液,輕輕吹打混勻,裂解4-5分鐘;

③ 加入20-30ml PBS、HBSS、生理鹽水或無血清培養(yǎng)液;

④ 2400rpm-2700rpm離心5分鐘,棄紅色上清;

⑤ 重復步驟③和步驟④,直至紅細胞裂解完全,收集細胞沉淀;

⑥ 每1×10^6個細胞加入1ml Trizol試劑,液氮速凍后,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

5、血清樣本采集備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴增不出來

① 用無抗凝劑血清管收集全血樣本,預留一定空間便于血清分離,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;

② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管(RNasefree)中;

③ 將分裝好的血清轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

6、血漿樣本采集備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴增不出來

① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使之與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;

② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管中;

③ 將分裝好的血漿轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

7、菌類1*10^8 CFU以上的菌體

液體培養(yǎng)基:

① 挑取單菌落于50ml液體培養(yǎng)基中,適宜溫度培養(yǎng)過夜,并在對數(shù)生長期進行菌體采集;

② 培養(yǎng)好的菌液適量轉(zhuǎn)入合適的離心管中,高速離心收集菌體,棄去上層培養(yǎng)基,用封口膜封口后液氮速凍,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存,大體積干冰運輸;

固體或半固體培養(yǎng)菌種收集:

① 涂布平板培養(yǎng)的微生物,在菌體生產(chǎn)最旺盛時期刮下,置于1.5或2.0ml的離心管中,迅速液氮速凍。

② -80℃冰箱保存,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存,大體積干冰運輸。

 

樣本準備注意事項:

① 小體積的昆蟲類組織,如寄生蜂、螨等,可考慮用RNA保護劑進行樣本收集,RNA保護劑的使用參照試劑說明書;

② 所有直接接觸樣本的試劑、耗材等物品均需要處于無RNA酶(RNasefree)環(huán)境;

③ 肝素會影響下游建庫測序,EDTA不適用于部分成分分析及PCR實驗,采集血液樣本時需根據(jù)檢測需求慎重選擇抗凝劑;

④ RNA樣本提取可采用RNA試劑盒、Tirzol法等,注意RNA樣本的純化,避免多糖多酚、蛋白和其它雜質(zhì)的殘留。提取完成后,提供Nanodrop、AGE或Agilent 2100中一種或多種形式的分析結(jié)果以判斷RNA的完整性、濃度、總量是否滿足需求。寄送TotalRNA的需注明提取所用的方法,如試劑盒或Tirzol法等;

⑤ 樣本標簽勿粘貼在EP管或錫箔紙上,低溫下標簽紙易脫落,建議使用記號筆標記;

⑥ 細胞樣本不建議采用粘稠保護劑保存,否則將無法離心收集存放在保護劑的細胞樣本;

⑦ RNAlater、RNAstore等保護劑在25℃下能穩(wěn)定保存樣本3天,4℃保存樣本7天、-20℃條件下可長期保存樣本。建議用保護劑保存的樣本厚度不超過0.5cm。保護劑不適用于血液和液態(tài)樣本,組織樣本與保護劑的用量至少為1:10,RNAstore不適用于植物樣本保存。(不同保護劑保存時間有差異,具體以保護劑說明書為準);

⑧ Trizol為裂解液,不適用于組織樣本的保存,細胞除外。當細胞存放在Trizol中需注明每管的細胞數(shù)量。

樣本寄送注意事項:

① 樣本需要使用干冰進行寄送,干冰消耗量為4-5kg/天(根據(jù)溫度會有所變動),訂購量以快遞實際運輸天數(shù)為準(避開大型節(jié)假日及線上購物節(jié))。干冰采用厚實的泡沫箱進行打包,外側(cè)用透明膠封好;

② 樣本寄送我司時需填寫《項目送樣單》。送樣單中樣本信息、數(shù)量、分組與編號需與實際保持一致,紙質(zhì)版送樣單隨樣本寄出,電子版送樣單及寄送快遞單號發(fā)送給公司,以便核對及備份數(shù)據(jù);

③ 在我司完成測序分析后,剩余樣本需要返還的項目,需在收到項目完整版結(jié)題報告3個月內(nèi)聯(lián)系我司進行樣本返還,逾期樣本將進行銷毀。如果樣本特別珍貴,需提前說明。樣本返回需要送樣方承擔返還費用(包括干冰費和快遞費);

④ 為確保實驗的順利,送檢方需盡可能提供樣本,以防部分樣本降解重新取材、制備或送樣,耽誤檢測進程。

分子生物學樣本采樣要求
發(fā)布時間:2024-03-07
作者:里來醫(yī)學

 

注:以下所有樣本盡量新鮮!

1、動物組織采集樣本量盡量保證在綠豆大小,約200mg以上

 取材應在冰上進行,取材后組織用生理鹽水沖洗干凈,去除血漬和污物,并剔除非研究所需的組織;

② 吸干水漬并切小塊,放入已標記的凍存管中,液氮速凍后,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

2、貼壁細胞RNA采集樣本樣本量1*10^8以上

RNA試劑盒法:

① 用微量移液器將細胞培養(yǎng)液吸除干凈,加入1ml 4℃預冷PBS溶液,輕搖洗滌;

② 將PBS吸除干凈后,再加入1ml PBS,用細胞刮收集細胞,3000rpm離心10min,棄去上清液,收集細胞沉淀,液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存;

③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說明書為準。提取樣本經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

Trizol法:

① 貼壁細胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,去除培養(yǎng)液;

② 每10c㎡培養(yǎng)面積加入1ml Trizol試劑;

③ 用1ml槍頭反復吹打,使Trizol與細胞充分接觸并消化;

④ 將上述溶液轉(zhuǎn)移到試管中,用一次性注射器(或者槍頭)反復吹打細胞,直至看不見成團的細胞塊,使溶液呈現(xiàn)清亮且不粘稠的狀態(tài);

⑤ 經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

3、懸浮細胞RNA采集樣本量1*10^8以上

RNA試劑盒法:

① 懸浮細胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,3000rpm,離心10min,去除培養(yǎng)液;

② 收集細胞后,加入1ml 4℃預冷PBS溶液,輕搖洗滌,3000rpm,離心10min,棄去上清液,收集細胞沉淀,液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存;

③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說明書為準。提取樣本經(jīng)氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱。

Trizol法:

① 懸浮細胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,離心收集細胞,去除培養(yǎng)液

② 保留的細胞用PBS快速洗一次,離心除去PBS;

③ 每1×10^6個細胞加1ml Trizol試劑,用一次性注射器進行反復吹打直至看不見成團的細胞塊,整個溶液呈清亮且不粘稠的狀態(tài);

④ 經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

4、血液樣本采集

全血樣本(以下方法步驟僅供參考)

哺乳動物需要采集白細胞進行后續(xù)實驗,(具體方法需參考各種分離液試劑說明書)

① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使血液與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立放置;

② 每1ml新鮮抗凝血中加入10ml紅細胞裂解液,輕輕吹打混勻,裂解4-5分鐘;

③ 加入20-30ml PBS、HBSS、生理鹽水或無血清培養(yǎng)液;

④ 2400rpm-2700rpm離心5分鐘,棄紅色上清;

⑤ 重復步驟③和步驟④,直至紅細胞裂解完全,收集細胞沉淀;

⑥ 每1×10^6個細胞加入1ml Trizol試劑,液氮速凍后,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

5、血清樣本采集備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴增不出來

① 用無抗凝劑血清管收集全血樣本,預留一定空間便于血清分離,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;

② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管(RNasefree)中;

③ 將分裝好的血清轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

6、血漿樣本采集備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴增不出來

① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使之與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;

② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管中;

③ 將分裝好的血漿轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存。

7、菌類1*10^8 CFU以上的菌體

液體培養(yǎng)基:

① 挑取單菌落于50ml液體培養(yǎng)基中,適宜溫度培養(yǎng)過夜,并在對數(shù)生長期進行菌體采集;

② 培養(yǎng)好的菌液適量轉(zhuǎn)入合適的離心管中,高速離心收集菌體,棄去上層培養(yǎng)基,用封口膜封口后液氮速凍,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存,大體積干冰運輸;

固體或半固體培養(yǎng)菌種收集:

① 涂布平板培養(yǎng)的微生物,在菌體生產(chǎn)最旺盛時期刮下,置于1.5或2.0ml的離心管中,迅速液氮速凍。

② -80℃冰箱保存,轉(zhuǎn)運至-80℃冰箱保存,大體積干冰運輸。

 

樣本準備注意事項:

① 小體積的昆蟲類組織,如寄生蜂、螨等,可考慮用RNA保護劑進行樣本收集,RNA保護劑的使用參照試劑說明書;

② 所有直接接觸樣本的試劑、耗材等物品均需要處于無RNA酶(RNasefree)環(huán)境;

③ 肝素會影響下游建庫測序,EDTA不適用于部分成分分析及PCR實驗,采集血液樣本時需根據(jù)檢測需求慎重選擇抗凝劑;

④ RNA樣本提取可采用RNA試劑盒、Tirzol法等,注意RNA樣本的純化,避免多糖多酚、蛋白和其它雜質(zhì)的殘留。提取完成后,提供Nanodrop、AGE或Agilent 2100中一種或多種形式的分析結(jié)果以判斷RNA的完整性、濃度、總量是否滿足需求。寄送TotalRNA的需注明提取所用的方法,如試劑盒或Tirzol法等;

⑤ 樣本標簽勿粘貼在EP管或錫箔紙上,低溫下標簽紙易脫落,建議使用記號筆標記;

⑥ 細胞樣本不建議采用粘稠保護劑保存,否則將無法離心收集存放在保護劑的細胞樣本;

⑦ RNAlater、RNAstore等保護劑在25℃下能穩(wěn)定保存樣本3天,4℃保存樣本7天、-20℃條件下可長期保存樣本。建議用保護劑保存的樣本厚度不超過0.5cm。保護劑不適用于血液和液態(tài)樣本,組織樣本與保護劑的用量至少為1:10,RNAstore不適用于植物樣本保存。(不同保護劑保存時間有差異,具體以保護劑說明書為準);

⑧ Trizol為裂解液,不適用于組織樣本的保存,細胞除外。當細胞存放在Trizol中需注明每管的細胞數(shù)量。

樣本寄送注意事項:

① 樣本需要使用干冰進行寄送,干冰消耗量為4-5kg/天(根據(jù)溫度會有所變動),訂購量以快遞實際運輸天數(shù)為準(避開大型節(jié)假日及線上購物節(jié))。干冰采用厚實的泡沫箱進行打包,外側(cè)用透明膠封好;

② 樣本寄送我司時需填寫《項目送樣單》。送樣單中樣本信息、數(shù)量、分組與編號需與實際保持一致,紙質(zhì)版送樣單隨樣本寄出,電子版送樣單及寄送快遞單號發(fā)送給公司,以便核對及備份數(shù)據(jù);

③ 在我司完成測序分析后,剩余樣本需要返還的項目,需在收到項目完整版結(jié)題報告3個月內(nèi)聯(lián)系我司進行樣本返還,逾期樣本將進行銷毀。如果樣本特別珍貴,需提前說明。樣本返回需要送樣方承擔返還費用(包括干冰費和快遞費);

④ 為確保實驗的順利,送檢方需盡可能提供樣本,以防部分樣本降解重新取材、制備或送樣,耽誤檢測進程。